صرح الدكتور مصطفى أمين، الأمين العام للمجلس الأعلى للآثار، بأنه تم اتخاذ كافة الإجراءات القانونية اللازمة للتحقيق في واقعة اختفاء ستة مشكاوات من مسجد الرفاعي بميدان القلعة، والتي تبين اختفائها اليوم الأحد الموافق 1/1/2017.
وأوضح أمين أنه فور إبلاغ وزارة الآثار بالواقعة، أحال الدكتور خالد العناني وزير الآثار الأمر للنيابة العامة للوقوف على جميع ملابسات اختفاء المشكاوات، كما قام بمخاطبة شرطة السياحة والآثار ومعالي وزير الأوقاف الدكتور محمد مختار جمعة باعتبار وزارة الأوقاف هي المسئولة عن قاعات المسجد، للتحقيق واتخاذ كافة الإجراءات القانونية اللازمة من جانبها.
كما أمر العناني بتشكيل لجنة لحصر جميع المقتنيات والمنقولات الموجودة بالمسجد.
وقال السعيد حلمي رئيس قطاع الآثار الإسلامية بالوزارة إنه بعد معاينته للمسجد تبين بالفعل اختفاء ستة مشكاوات من أصل خمسة عشر مشكاة كانت موجودة بحجرة الملك فؤاد والأميرة فريال.
وأضاف أن المشكاوات المختفية تعود لعام 1328 هـ وهي مصنوعة من الزجاج المموه بالمينا عليها رنك باسم الخديوي عباس حلمي الثاني وكتابات بخط الثلث المملوكي لآية من سورة النور:" الله نور السماوات والأرض مثل نوره كمشكاة فيها مصباح".