قال الدكتور محمد معيط، إن هناك عدة مزايا تنتج عن تطبيق نظام الـ GFMIS، تتمثل في سرعة التواصل إلكترونيًا، مع وزارة المالية، والتخطيط، وتوفير معلومات دقيقة، ولحظية، وتحسين عملية الرقابة على الحسابات المالية، وعدم تجاوز الاعتمادات المالية المقررة بالموازنة، بالإضافة إلى اختصار الوقت والجهد في إعداد الحسابات الختامية، وتوفير قاعدة بيانات تاريخية دقيقة عن حجم المصروفات، والإيرادات، لكافة الوحدات، وتسهيل عملية تطبيق موازنة البرامج والأداء.
وأشار إلى وجود تكامل بين نظام إدارة المعلومات المالية، ونظام أوامر الدفع الإلكتروني، حيث لن يتم إصدار أوامر دفع إلكتروني إلا بعد إدخال أرقام قيود المرحلة، والتي يجب أن تتوافر فيها مجموعة من الشروط تشمل، الاعتمادات المالية، سماح حد الصرف النقدي، والالتزام بالتأشيرات العامة والخاصة.
كما سيتم توحيد كافة الحسابات المصرفية الخاصة، بالوحدات الحسابية في حساب الخزانة الموحد، بالبنك المركزي كخطوة هامة نحو ميكنة كافة مراحل دورة الموازنة العامة للدولة.