استنكرت الخارجية السودانية انعقاد مؤتمر برلين دون التنسيق مع الحكومة أو دعوتها، معتبرة أن تجاهل رؤية الدولة الرسمية بذريعة "الحياد" يمثل سابقة خطيرة في العلاقات الدولية وانتهاكًا صريحًا للسيادة الوطنية السودانية.
كما حذرت الوزارة من خطورة المساواة بين الجيش السوداني و"المـيليشيا الإرهــابية" التي تستهدف مؤسسات الدولة، مؤكدة أن هذا النهج يشرعن الإجـ ـرام ويقوض أسس الأمن الإقليمي والدولي.